Im Jahr 2011 wurde die neue Generation 3 des MatrixTool veröffentlicht. Eine der Hauptänderungen, besteht darin, das alle Fenster und AddOn''s in einem Hauptfenster verwaltet werden und die Integration der Scanner der Produktserien Matrix210, Matrix410 und Matrix450. Zudem wurden weitere neue Funktionen, wie ein Verkabelungsassistent eingeführt.

Im Jahr 2013 wurde die Entwicklung der Version für Microsoft Windows eingestellt.